Notícia

Microfluídica: projetos abertos facilitam pesquisas na área da saúde

Oxigenador microfluídico. Divulgação.

Fonte

MIT

Data

sexta-feira, 16 junho 2017 11:55

Áreas

Microeletrônica. Microfluídica. MEMS. Engenharia Biológica. Engenharia Biomédica.

Um novo site de código aberto desenvolvido pelo Instituto de Tecnologia de Massachusetts (MIT) pretende ser referência em microfluídica. O site, Metafluidics.org, é um repositório gratuito de projetos para dispositivos de laboratório em um chip, submetido por todos os tipos de desenvolvedores, incluindo cientistas e engenheiros, hobistas, estudantes e inventores amadores. Os usuários podem navegar no site por dispositivos que vão de simples classificadores de células e misturadores de fluidos, até chips mais complexos que analisam fluidos oculares e sintetizam sequências de genes.

O site também serve como uma plataforma social para a comunidade de microfluídica: qualquer usuário pode fazer login para enviar um projeto; Eles também podem curtir, comentar e baixar arquivos de projetos para reproduzir um dispositivo em destaque ou melhorá-lo.

O Dr. David S. Kong, diretor da Iniciativa Comunitária em Biotecnologia do MIT Media Lab, diz que o novo site é projetado para acelerar a inovação no design microfluídico, que até agora seguiu uma rota convencional, revisada por pares.

“Há uma experiência familiar para as pessoas em microfluídica: você vê um artigo realmente incrível que mostra um design, mas se quiser tentar copiar o projeto, os arquivos reais, que são uma parte crítica da reprodução ou remixação de um dispositivo, não são compartilhados de forma sistemática “, diz o Dr. David Kong. “Como resultado, pesquisadores de todo o mundo estão paralelamente reinventando a roda. É uma das razões pelas quais a fonte aberta em geral é um conjunto muito poderoso de princípios. Pode realmente acelerar a difusão da tecnologia “.

O Dr. David Kong e seus colegas delinearam a plataforma de código aberto em um artigo publicado na edição de junho da revista científica Nature Biotechnology. Seus co-autores são Dr. Todd Thorsen, Dr. Peter Carr e Dr. Scott Wick do Laboratório Lincoln do MIT; Dr. Jonathan Babb e Dr. Jeremy Gam, do Departamento de Engenharia Biológica; e o Dr.  Ron Weiss, professor de engenharia biológica e de engenharia elétrica e informática.

Um ecossistema aberto

Os pesquisadores modelaram seu site de Metafluidics após populares repositórios de código aberto, como o GitHub – um site gratuito que hospeda projetos de software de fonte aberta – e Thingiverse, um site que possui arquivos de design de hardware para brinquedos, gadgets e robôs criados pelo usuário.

O Dr. David Kong surgiu com a idéia de Metafluidics como biólogo no Lincoln Laboratory, onde trabalhou para combinar fragmentos de DNA para reprogramar novas funções em células vivas. Para fazer isso, ele usou regularmente depósitos de DNA, como o GenBank dos Institutos Nacionais de Saúde dos Estados Unidos – um banco de dados disponível publicamente através do qual os cientistas podem compartilhar e acessar sequências genéticas e suas funções associadas.

“Houve um pouco de compartilhamento de diferentes tipos de informação em torno da biologia sintética”, observa o Dr. David. “Então, esse tipo de movimento de código aberto na biotecnologia é importante e esperamos preencher esta parte fundamental do ecossistema que está especificamente relacionado ao hardware”.

Acesso ao site

A equipe trabalhou com a Bocoup, uma empresa de consultoria de software de fonte aberta, para projetar uma plataforma de código aberto para compartilhar projetos microfluídicos. Para acessar o site gratuito, os usuários preenchem um breve perfil para efetuar o login, após o qual eles podem navegar através de dispositivos em destaque ou procurar o site para funções específicas de microfluídica.

Cada dispositivo disponível no site inclui uma breve descrição, juntamente com uma lista de materiais utilizados para fabricar o chip e seus arquivos de projeto, como desenhos em computador (CAD).

“Microfluídica de papel, chip para litografia e impressora 3-D, todas essas técnicas requerem o arquivo de projeto digital”, diz o Dr. David Kong. “Isso é o que estamos disponibilizando pela primeira vez para a comunidade “.

O site está atualmente preenchido com projetos enviados por estudantes e hobistas, juntamente com especialistas líderes na área, como o Dr. Thorsen, que contribuiu com vários dispositivos.

Acesse o artigo científico completo (em inglês).

Acesse o site Metafluidics.org.

Leia a reportagem completa do MIT.

Fonte: Jennifer Chu, MIT News Office. Imagem: Oxigenador microfluídico. Divulgação.

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